Да, родители наследодателя, имеют право претендовать на имущество, принадлежавшее наследодателю на день смерти, поскольку согласно ст.1112 ГК РФ в состав наследства входят принадлежавшие наследодателю на день открытия наследства вещи, иное имущество.
Мировое соглашение, содержащее условия об обещании дарения, не было реализовано при жизни наследодателя, государственная регистрация перехода права на квартиру на основании определения суда об утверждении мирового соглашения не производилась, в связи с чем, для защиты прав несовершеннолетнего Вам не только необходимо обратиться в суд за признанием права собственности на спорную квартиру за Вашей дочерью, но и ходатайствовать суд приостановить выдачу свидетельства о праве на наследство в рамках требований п.3 ст.1163 ГК РФ.